东京游戏展2009现场召开了每年一届的“日本游戏大奖2009”的颁奖仪式，除了历届日本游戏大奖的重头“年度作品奖”外，还继续颁发了去年新创立的奖项“经济产业大臣奖”。

    “经济产业大臣奖”是表彰对家用游戏产业的发展做出杰出贡献的人物或团体，本年度获得该奖项的是CAPCOM公司的“《怪物猎人》开发团队”，该系列的制作人辻本良三代表开发团队领奖并发表感言。

    “年度游戏奖”又分为“全球奖”、“热销奖”、“特别奖”和“优秀奖”四个分类。荣获“全球奖”的是日本国产游戏《Wii Fit》和海外作品《横行霸道IV》两款游戏；“热销奖”则由日本国内销量达240万、全球累计销量566万套的《口袋妖怪 白金》获得；获得“特别奖”的是《怪物猎人 2nd G PSP the Best》和《我们的时装店：女生风格》。

    最受瞩目的“优秀奖”汇集了年度最佳游戏11款（具体如下），其中《马里奥赛车Wii》和《潜龙谍影4 爱国者之枪》同时荣获代表最高荣誉的“日本游戏大奖（最优秀奖）”。

・《纷争 最终幻想》（PSP）
・《恶魔之魂》（PS3）
・《生化危机 5》（PS3/X360）
・《女神异闻录4》（PS2）
・《口袋妖怪 白金》（NDS）
・《马里奥赛车Wii》（Wii）
・《潜龙谍影4 爱国者之枪》（PS3）
・《428 ～被封锁的涉谷～》（Wii）
・《旋律天国 金》（NDS）
・《如龙3》（PS3）
・《莱顿教授与最后的时间旅行》（NDS）